La investigación de la Fiscalía General del Estado, a través de la Unidad de Transparencia y Lucha Contra la Corrupción, inició por una denuncia por presuntos actos de corrupción, presentados contra Francisco B. A. por parte de un exfuncionario de la Vicepresidencia de la República de Ecuador, a quien se le habría ofrecido un cargo en esa entidad estatal a cambio de un porcentaje de su remuneración mensual.
Según lo manifestado por el presunto perjudicado, junto con Francisco B. A. –hijo de la vicepresidenta de la República, Verónica A.– habrían acordado la entrega de 1.700 dólares mensuales y habrían firmado una letra de cambio por 30.600 dólares, el monto correspondiente a un año.
En el proceso de investigación también se estableció una presunta participación de la segunda mandataria, por tal razón la causa fue desplazada a la Unidad de Fuero de Corte Nacional.